Transdisziplinäre Forschung stellt die Akteure vor große Herausforderungen. Auf allen Ebenen ist mit einem hohen Komplexitätsgrad zu rechnen. Die Beteiligten müssen über spezifische Kompetenzen verfügen, um den Prozess gelingen lassen und eine integrative Problemlösung durch eine erfolgreiche Integration der unterschiedlichen Wissensressourcen erreichen zu können. Für die Evaluation bedeutet das, neben der strukturellen, auf den Prozess bezogenen und inhaltlichen Analyse des Projektes, auszuloten, inwieweit die Akteure des Projektes über die entsprechende Kompetenz verfügen.