Inter- und transdisziplinäre Forschung zur Transformation des Energiesystems findet zu einem großen Teil in Forschungsprojekten statt, wie die Beiträge in unterschiedlichen Teilen des Handbuchs zeigen. Die Projekte werden von unterschiedlichen Fördermittelgebern über diverse Programme unterstützt. Bei der öffentlichen Energieforschung in Deutschland lassen sich wenigstens drei Ebenen unterscheiden, die im jährlichen Bundesbericht Energieforschung dargestellt werden.